當喬爾找到艾莉時，她正躲在一間廢棄的房屋內偷偷哭泣。
喬爾和艾莉說明了自己的意圖，同時也明白了艾莉的想法，誤會就此化解，喬爾和湯米告別之后，帶著艾莉繼續前往“火螢”位于科羅拉多大學的研究所。
此時已經進入了隆冬時節，大學校園內無比蕭瑟，偌大的校園空無一人，只有一些野生動物把這里當成了它們的新家，在樓宇間肆意地奔跑著。
等他們趕到“火螢”的實驗室時才發現，這里早已經人去樓空了。
由于實驗的失敗，再加上不斷涌現出的感染者，“火螢”的人已經放棄了這里，全部撤去了鹽湖城，在那里建立了新的研究所。
就在二人商議是否應該前往鹽湖城之時，一群“獵人”追殺到了這里，雖然苦戰之后喬爾和艾莉將他們悉數消滅，但戰斗間喬爾的腹部也被一根鋼筋洞穿，身受重傷。
為了照顧受傷的喬爾，艾莉只得帶著他先在附近的一處居民樓內暫時定居。
在喬爾昏迷期間，“獵人”組織的老大，大衛也帶著人追到了此處，艾莉巧施放妙計從他手上騙到了一些抗生素，注入了喬爾體內，隨后孤身一人將“獵人”們全部引走，以確保喬爾的安全。
而醒來的喬爾自然是滿世界去找他的女兒，父女二人合力解決掉大衛，一把火燒毀了這處“獵人”的大本營。
時光流轉，又到了一年的春天。
喬爾和艾莉已經在一起度過了一年的時光，經過一年的跋涉，位于鹽湖城圣瑪利亞醫院的研究所已近在眼前，他們的旅程終于要結束了。
艾莉看上去有些悶悶不樂，喬爾騎在馬上也沉默不語，二人都明白，已經到了分別的時刻。
但在渡過一條暗河之時，意外發生了。
重傷初愈的喬爾行動有些不便，一個不留神落入了水中，危急時刻，艾莉不顧自身安危，毫不猶豫跳入水中想要去幫助喬爾。
二人最后雖然都成功上岸，但艾莉卻因冰冷的河水激活了她體內的真菌，從而陷入了沉沉的昏迷。
看著不省人事的艾麗，喬爾一下子慌了神，此時此景正如二十年他失去女兒莎拉的那一幕一模一樣。
當他看到“火螢”的人趕來時，就仿佛看見了救星一般。
然而“火螢”的人只是匆匆看了眼艾莉的狀況，隨后不由分說一槍托砸在了喬爾的后腦勺上，毫無防備的喬爾當即就兩眼一黑，昏了過去。
等他醒來之時，發現他正處于一間手術室中，周圍站著數名手持長槍的“火螢”士兵，而昏迷的艾莉也正躺在那手術臺上。
此時手術臺邊的瑪琳才對喬爾說出了實情。
原來，想要得到疫苗，就必須犧牲艾莉。
殺一人而救千萬人，你是否愿意呢？
如果這個人是你在這世上最親近的人，你又是否愿意呢？
神里綾華自問自己是不會答應的，雙親過世后，如果再有人要從她身邊奪走哥哥，不管那人是何目的，綾華都絕對會和他拼命到底。
喬爾的答案，同樣也是如此。
他一把奪過士兵手中的槍，直接化身為終結者，手術室內的人全部成了他的槍下亡魂。
抱起被麻醉的艾莉，喬爾一個箭步沖出了手術室，登上電梯就往一樓而去。
然而，電梯門剛一打開，一個黑洞洞的槍口就對準了喬爾的額頭。
瑪琳早已在這里等著了。
她堅持讓喬爾把艾莉留下，因為這是拯救人類的希望。
瑪琳不想對喬爾開槍，她曉之以情動之以理，打了好一通嘴炮。
聽完她的話，喬爾也漸漸垂下了頭，似乎陷入了沉思。
見此情形，瑪琳也逐漸放下了槍，表示了自己的善意，慢慢向喬爾靠近過去，想從他手中接過艾莉。
“砰！”
原來喬爾一直在等瑪琳放松警惕，一看有機會，他果斷扣下了扳機，瑪琳瞬間倒在了冉冉血泊之中。
二十年的末世生活，造就了一個殺伐果決的喬爾，為了保護艾莉，他不會有一絲憐憫。
逃出“火螢”的研究所后，喬爾帶著艾莉，回到了弟弟湯米所在的生活區。
期間艾莉也問起過，那天在研究所內究竟發生了什么。
喬爾撒了個謊，告訴她實驗又一次失敗了，她并不是那個能拯救世界的天選之人。
現在，她只要和他一起，在這邊安全區內平靜的生活下去就行了。
《最后生還者：第一章》的故事就此結束。
“這個結局，還挺不錯的...”
在沙發上坐了十幾個小時，總算是通關了，神里綾華從座位上站起身來，伸了個大大的懶腰。
這個關于愛和拯救的故事，帶給了她極大的震撼。
相較于那些令人恐懼的感染者，人與人之間的爾虞我詐顯然更讓人絕望。
沒了道德與法律作為緩沖區，人與人之間的矛盾顯得直接而血腥，整個國家都變成了一片黑暗叢林。
喬爾從頭到尾就不是一個英雄，甚至不是一個好人，只是一個在末世中艱難求生的普通人而已。
直到他遇到艾莉，他才找到了他人生的新目標。
至于喬爾最后的決定，作為一名旁觀者，綾華認為并不能簡單地去評判是對是錯。
未經他人苦，莫勸他人善。
世界與至親孰輕孰重，這個問題并沒有標準答案。
假如讓她在稻妻和哥哥之間做出選擇，綾華認為自己更愿意去保護哥哥。
對她而言，她愛稻妻，但更愛綾人，那位從小守護著自己的兄長。
向著朝陽，神里綾華大步走出了網吧。
她又迎來了嶄新的一天。
為了家族的復興，為了給兄長分憂，她還要更加努力才是啊。
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