忍界的混亂局勢越來越嚴重。
木葉的高層沒想到，趁火打劫的不是一直防備的巖忍或云隱，反而是一直不放在眼中的雨之國。
這對于一向自詡忍界第一大村的木葉是無法容忍的，他們有必要讓雨之國明白，大國的尊嚴不容挑釁。
因此，第二波部隊的派出是寄予了厚望的，雖然人數只有三千，卻盡是大族精銳。
而且，就算只有三千的忍者，在數量上也高于雨之國，這就是大村的底蘊。
于是，雨忍村與木葉再次交鋒在一起，山椒魚半藏也表現出了讓整個忍界為之側目的實力，面對火之國龐大的力量，竟取得了連勝，打的木葉第二部隊連連后退。
整個火之國的西部，被雨忍村牢牢的占據了一大塊。
不過木葉的部隊也是訓練有素，這種情況下收攏忍者，修建出一道道的防御陣地，開始與雨忍村對峙。
而震怒的木葉高層徹底的爆發了村子的戰爭的潛力，高手開始源源不斷的支援戰場，雨忍村面對的壓力越來越大。
這場戰爭是漫長的，從木葉第四十二年十月，一直持續到木葉第四十三年六月，大半年的時間中，木葉始終未能將雨忍村徹底擊潰。
這種情況下，讓一直觀察著忍界形式的巖忍村念頭大動，看起來現在的木葉已經自顧不暇了，如果在這種時候再去攙和一腳……
然而就在巖忍村猶豫的時候，木葉被徹底逼急了，三代火影猿飛日斬，與志村團藏一起，親赴雨忍村戰場。
忍術博士與半神的正式對話展開了。
那一戰，根據目睹者的回憶稱，是他們見過的最恐怖的戰斗，地形都被兩人的戰斗所影響，天空中云層變化，根本就是兩個怪物。
而最終，山椒魚半藏獨木難支，在猿飛日斬和志村團藏兩人的聯手之下，半藏終究不敵，雨忍村與開始敗退。
戰場漸漸轉移，由火之國境內往雨之國壓去，場面徹底的鋪開，一場在雨之國的攻防戰開始打響，戰火燒遍整個雨之國。
此時，雨忍村已經處于下風，待到局勢稍稍穩定后，三代火影重新回到村子坐鎮。
木葉第四十三年七月，砂隱村展開一場蓄謀已久的反攻，木葉部隊在措不及防之下損失慘重，千手一族的一位影級強者陣亡，被迫退回河之國與風之國邊境。
戰爭依舊持續著，彌漫的硝煙中，時間快速的流逝，戰場上的忍者朝不保夕，不知道今天閉眼后是否能夠看到明天的太陽。
從戰國時代到如今，口口宣揚著和平的到來，最終卻發現，忍者的宿命似乎沒有丁點的改變。
木葉第四十四三月年，砂隱 ，砂隱村計劃偷襲木葉部隊后方，欲切斷整個木葉部隊的補給線，卻意外的被木葉的一個小隊潛入得知。
隨后，這個小隊的隊長讓同伴帶著情報率先離開，只身斷后，于砂隱村眾多高手中硬生生的殺出一條血路，就連三代風影都未能將他留下。
其名，旗木朔茂。
此戰，旗木朔茂一戰成名，出神入化的瞬身術，配上旗木一族特有的刀術，以及他強悍的雷遁，在整個砂隱村戰場如一顆耀眼的新星升起。
雖然早在之前他就小有名聲，可最能獲得聲望的地方，卻無疑是戰場，伴隨著每一次的忍界大戰，終究會有新一代的忍者崛起。
而因為他短刀揮出時速度太快，往往只有一道如獠牙的白光，砂隱村的忍者更愿意成他為木葉白牙。
伴隨著挫敗了砂隱村的陰謀，白牙在木葉忍者中的地位也迅速提升，在砂隱村的戰場上異常的活躍。
木葉第四十五年五月，雙面開戰的木葉決定先結束一個戰場，然后再集中優勢力量取得另一個戰場的勝利。同時，巖忍村和云隱村遲遲不動，也讓木葉判斷他們或許不會加入這次的戰爭。
最終，木葉將目標選在雨之國，決定先把力量相對弱小的雨忍村干掉。
于是，在木葉村高層的決議下，在砂隱戰場的綱手也被調到了雨忍戰場，同時村子中更多的高手被派去支援。
而此時，雨之國身為小國的劣勢早在數年的戰爭中被暴漏無疑，他們無法同木葉這種龐然大物拼消耗戰，忍者的數量，高手的數量，戰爭的儲備，忍者的裝備，一系列的條件都處于下風。
而雨忍村中，除了半藏外，沒有第二個能拿的出手的高端戰力，也是事實存在的問題。
在木葉猛的又增援后，雨忍村的形式變的岌岌可危起來。
在這種情況下，半藏不得已向巖忍村求援，請求他們支援雨之國。木葉第四十五年七月，早已經在一旁觀戰了不知多久的巖忍村欣然接受了半藏的請求，并以一種維護正義的姿態參與進了這場戰爭。
小小的雨之國境內，三個忍村的忍者亂成一團，整個雨之國烽火燃燒，大部分地方被破壞一盡，無數人流離失所，每天都有新的難民產生。
而養精蓄銳多時的巖忍村，在一開始就拿出了強大的主戰部隊，和木葉的精銳部隊狠狠的撞在一起，場面異常激烈。
三代土影打著自己的精明算盤，他坐壁上觀這么久，就是在等待著如今的機會。
戰爭已經持續了四年多的時間，木葉的疲倦已暴露出來，正是撿便宜的最好時機，再加上雨忍村半藏的求援，他們加入戰爭可謂名正言順。 甚至等戰爭結束后，還可以順勢將雨之國納入附屬國中，再增強土之國的力量，可謂一舉數得。 .