此戰明軍共計斬殺叛軍首級兩萬余顆，俘虜了三萬多人，并將賊首奢崇明給擒獲，已然獲得了完全勝利。
當朱由校收到這份捷報以后，只是淡淡的下令御營移駕回重慶，并讓秦邦屏和秦良玉組織他們的部隊，進山掃蕩叛軍殘部，以及盤踞在深山的土匪。
至于奢崇明，朱由校根本就沒把他放在眼里，不過是一個小角色而已，在歷史上，除了一開始造反的時候，趁著當地官員以及軍隊毫無防備打了幾個勝仗，其他的全是敗績。
但就算朱由校再怎么瞧不上他，作為首逆的奢崇明，也注定不會有好下場。
朱由校下令將他押回了重慶，按照大明律，處以凌遲并誅殺九族，將頭顱掛在城頭上，并號召重慶的百姓都來觀斬。
處理完了余逆之事，朱由校又親自統領大軍，與陳廣會合后，水陸并進，朝瀘州進發。
瀘州的奢寅，敗的比他父親奢崇明還要快，早于奢崇明敗逃之前，明軍就一舉拿下了瀘州。
朱燮元和王平采取聲東擊西的戰術，在同一時間，在不同的地點渡江，瞞過了一向較為精明的奢寅。
奢寅與他的父親是一樣的遭遇，都是在戰斗進入白熱化時，被官軍給兩面夾擊，從而迅速潰逃。
他本就只有五千多人，經此大敗，傷亡過半，哪里還是官軍的對手。
在撤退回永寧的途中，又遭到一股來歷不明的官軍阻擊，奢寅傷亡慘重，只得遁入深山老林，尋求逃命。
奢寅雖然敗的與他父親極為相像，但命卻大了很多，他沒有被明軍抓捕，真的逃出生天了。
等朱由校來到瀘州將具體情況和局勢了解后，不在去管奢寅死活，任由他去，他們沒地方跑，早晚還是要上斷頭臺的。
瀘州作為奢逆的后勤保障基地，所存放的糧食自然是不會少的，足足有十五萬石，金銀倒是少的很，加起來還沒超過十萬兩，不過這已經不重要了。
他統領著大軍徑直南下，朝奢逆的大本營，永寧宣慰司而去，在哪里他有更重要的事要做。
奢崇輝并不知道自己的兄長和侄子已經大敗，并且皇帝已經親領大軍來征討他的事。
眼下他正灰頭土臉的帶著奢崇明留給他的兵馬，與魯欽所部官軍死戰呢。
他和前方的聯系都不知道斷了多久了。
魯欽是川中名將，年輕之時參與了許多平反的戰役，可謂大顯身手，那時就已小有名氣。
而后經過時間和資歷的磨練，魯欽逐漸成長為名震四川的名將，被冠以西南大將之稱。
但這些戰功，在百官和皇帝眼中根本不值一提，因此一直擔任個小小的兵備，駐守在成都。
此次單獨領兵一萬，進攻叛逆的大本營，可以說是委以重任了，在與奢崇輝的數次交戰中，他都接連獲勝，大放異彩。
但苦于沒有攻堅的利器和大型的攻城器械，被阻攔在城墻和要塞之外，一直無法深入敵境，擴大戰果。
當朱由校趕到的時候，直接將幾十門火炮架了起來，對著這些土司辛辛苦苦構筑起來的防線和土墻就是一頓狂轟濫炸。
有了火炮的支持，攻破這些與山寨土匪窩一般的要塞城池根本不費吹灰之力。
奢崇輝滿打滿算不到萬人，怎么可能是數萬明軍的對手，面對明軍井井有條、有極為猛烈的攻勢，奢崇輝了不到半天，就兵敗身死，與他的兄長團圓去了。
朱由校又用了三天的時間，這三天之內，明軍四處出擊，攻占被土司們管轄統治了數百上千年的地區。
將叛軍的余孽徹底剿滅，只要是屬于永寧宣慰司管轄的族群和土司，不管你有沒有實質性的參與謀反，不管有沒有證據，一律把軍事武裝解除了。
然后押著他們的首領以及重要人物，凡是有一點影響力的全部帶走，去御營見駕。
凡有不從或反抗者，明軍根本就不和你說二話，直接就操刀子開始行動，不論你是老弱婦幼，都一律誅殺，毫不留情。
這些土司制度下的平民，與漢人和大明朝廷根本不是一條心，他們甚至仇視漢人和漢人王朝，因此也沒什么必要對他們網開一面。
天底下最不缺的就是人，朱由校甚至在為大明朝的人口而煩惱，糧食就這么多，卻要養數千萬人，實在是太難了，趁此機會給自己減減壓也是好的。
在處置了好幾個寨子和村莊以后，官軍暴戾嗜殺的名聲迅速傳遍了永寧以及周邊地區的各個角落，所有人都被殺的膽寒了。
只要官軍的旗幟一到，就乖乖的配合，無有敢不從者，因為那些不服的，想要搞鬼作亂的，已經全部成為了官軍的刀下鬼。
隨后明軍全面接管所有地區和寨子，只要是有房屋人煙的地方，就有明軍管控值守，一環扣一環，滴水不漏。
其實這只不過是一個借口，你是忠臣還是逆賊，不過是朱由校一句話而已。
如果真的只是打一仗，殺個奢崇明，那又他何必千里迢迢跑到這里來。
土司變制、改土歸流才是最終的目的，只有這樣，才能改變現在這固化的階層制度，才能解放出底層的平民百姓。
西南這大大小小的土司，就算沒有一千也有六七百了，不剿殺了幾個，抓幾個典型出來，這改土歸流還真的不好操作。
全面管控了整個永寧宣慰司后，又進行了一次簡易的人口普查，發現了十幾萬個黑戶和隱戶，還有不計其數的奴隸。
這些人口，不管在地方官府的造冊上還是戶部，都是沒有任何記錄的，仿佛不存在于世間一樣。
這是封建王朝的通病，任何一個朝代都有這樣的存在。
朱由校專門調集成都的官員前來永寧，先給他們重新造冊編撰戶籍，并從繳獲的糧食當中分出一批來，先養著他們，免得生亂。
等到四川局勢徹底穩定以后，就要開始為他們分發田地和房屋，正好也從這些土司當中收回了不少的土地，這些地可都是要人種的。
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